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费城儿童医院 (CHOP) 和加州大学洛杉矶分校 (UCLA) 的研究人员开发了一种计算平台，能够发现源自替代 RNA 剪接的肿瘤抗原，从而扩大癌症免疫治疗靶标库。5 月 16 日发表在美国国家科学院院刊上的一篇论文描述了该工具，称为“用于免疫治疗靶标筛选的 RNA 剪接异构体肽”(IRIS) 。
“免疫疗法彻底改变了癌症治疗，但对于包括儿科癌症在内的许多癌症，抗原库是不完整的，这凸显了扩大可操作免疫治疗靶标库存的必要性，”该研究所所长、共同资深作者 Yi Xing 博士说。 CHOP 的计算和基因组医学中心。
“我们知道异常的可变 RNA 剪接在癌症中很普遍，并产生了一系列潜在的免疫治疗目标。在我们的研究中，我们能够证明我们的计算平台能够识别由可变剪接产生的免疫治疗目标，引入广泛适用的发现由此过程产生的 新型癌症免疫治疗靶点的框架。”
癌症免疫疗法在许多血液系统癌症的治疗中迎来了翻天覆地的变化，利用患者自身免疫系统的力量来对抗疾病。嵌合抗原受体 T 细胞 (CAR-T) 和 T 细胞受体工程化 T 细胞 (TCR-T) 疗法修饰患者自身的 T 细胞以攻击癌细胞表面的已知抗原，并且通常会导致对癌症的持久反应这曾经被认为是无法治愈的。
然而，该领域在实体瘤领域遇到了挑战，这在很大程度上是由于缺乏针对这些癌症的已知和合适的靶标，这突出表明需要新的方法来扩大免疫治疗靶标库。
可变剪接是一个必不可少的过程，它允许一个基因根据 RNA 在翻译成蛋白质之前被切割和连接或剪接的位置来编码许多基因产物。然而，癌细胞中的剪接过程失调，癌细胞通常利用这一过程产生促进生长和存活的蛋白质，从而使它们无法控制地复制和转移。这发生在许多成人和儿童癌症中。
